В теории канонический урл, должен помочь в SEO, но на практике все оказывается наоборот — появляются дубликаты страниц (позже расскажу как это происходит).
Недавно приняли патч позволяющий сделать это.
$Configuration['Garden']['Modules']['NoCanonicalUrl'] = TRUE;
Update 24 Sep 2011: Рассказываю как происходит что канонический урл плохо влияет на SEO